2023年6月30号下午,有幸受到了科研主管校长关于SCI论文写作辅导的指导,受益匪浅,对我在科学研究领域的成长有重要的指导意义。现将本次培训指导心得总结如下:
一、明确科研方向
指导中,结合我之前的研究方向,抓住学科优势,指出了全新的临床思路,明确了我后期的研究课题。
二、善用搜索引擎
在众多的文献搜索中,重点讲解了Pubmed的使用方法。PubMed是互联网上使用最广泛的免费MEDLINE检索工具,是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的生物医学信息检索系统,因而PubMed面向的检索用户为全球用户,其通用语言为英语。作为国际知名数据库,其内文献存在较高的权威性。在使用PubMed进行检索时,首先确定好准确的主题词,在确定英文主题词时,可依托不同数据库进行主题词的获取。为了能更好的领悟pudmed的使用方法,我对培训中讲解的使用方法做了一个简单的使用手册,作为后期的学习和分享(手册见附件)。
三、文献归类整编
在众多文献中搜索150篇左右的论文,每10篇为一组,对其进行总结与归纳,详细记录这些论文的科研团队、科研带头人,在国际上有哪些影响。然后按其相关性再次进行分组,并深度思考,探索新的设想、理论、意义、价值等,从而形成自己的理论。
四、计划进度安排
在指导中,针对我们的实际情况,制定了“4个3”的科研战略,即将整体进度定为一年,每三个月为一个阶段,每一阶段完成一个进度:
第一个3个月:搜索查阅文献,总量百篇以上,寻找论文价值;
第二个3个月:学会深度思考,明确研究思路,设计主体框架;
第三个3个月:扩大研究范围,扩充主体框架,建设论文内容;
第四个3个月:梳理语言逻辑,突出创新价值,提高论文质量;
一直以来对于论文的写作,尤其是高质量论文的写作不得要领,经过此次的指导,使我们快速熟悉了整个论文书写的逻辑,后续的时间里我们会继续努力,在高质量的论文领域中从无到有,一点点实现科研能力的跃升。
附件:
一、搜索
01 确定选题
在科研课题决定之初,利用Pubmed进行充分的文献调研早已是一件家常便饭的事情,然而让人头疼是,在搜索关键词后,跳出的结果大多不是自己想要的内容,很多与关键词不匹配的文章充斥其中,无疑加大了研究者文献筛选的工作量。 举个栗子,打开Pubmed网页之后,在检索框中,输入Inflammatory bowel disease TNF后,点击“Search”或按Enter键,结果如下图所示。
显然,对于输入Pubmed的多词词组,它会查询词组索引,如果查到相应词组会将其作为一个检索词来检索,但如果没有查到相应词组,则会将其拆分成单个词分别检索。所以Inflammatory bowel disease TNF就相当于Inflammatory AND bowel AND disease AND TNF。
如果不想把词组分开咋办?方法很简单,四个锦囊妙计送给你:
1)加双引号:“Inflammatory bowel disease”TNF;
2)加标段标识[tw]:Inflammatory bowel disease[tw] TNF;
3)加短横线:Inflammatory-bowel-disease TNF;
4)加截词符*:Inflammatory bowel disease* TNF
02 MeSH查缺补漏
但是问题又来了,Inflammatory bowel disease还有一种缩略写法IBD,上面的搜索方式无疑会漏掉一些文献,而且还有一些关键词还会有很多同义词,不是一次性搜索就会全部出现的。此时,Pubmed里的一款总结同义词的利器——MeSH霸气上线了。
以liver cancer lncRNA为例,在MeSH里输入liver cancer,就会跳出主题词liver Neoplasms,这名词看上去可就高大上多了。
点击第一个主题词liver Neoplasms后,可寻找相应的副题词并进行打钩后,点击右边上的“Add to Search builder”加到你的关键词构建(PubMed Search Builder)中。这样第一条关键词就是“肝肿瘤的遗传学分析”
然后不要退出,继续输入关键词lncRNA,也通过“Addto Search builder”加到关键词构建中,这个时候需要注意的是,用“And”这种逻辑语言的话,就代表求交集了,当然还可以自主换别的逻辑语言。构建完你的关键词之后,点击了“SearchPubMed”就OK了。
03 精确检索文章
当然你要是有所针对的或特异性的搜索具体作者、杂志或者其他信息等,还可以进行更加高级的检索,点Advanced就可以了!
进去之后是个这个界面,检索之后的步骤就是一样的了:
又或者,在Pubmed的主页面中,点击Pubmed Tools中的Single Citation Matcher,进入以下界面,输入特定的杂志、日期、作者名字(第一作者或通讯作者)即可靶向某篇特定的文章。
04 获取全文攻略
Pubmed是摘要数据库,其本身并不提供文献全文服务。对于检索到的文献,若检索结果列表中显示的PMC Full text 图标的文章。这类文章可以直接到PMC 中去阅读网页版的全文,或者在网页版全文阅读页面找到PDF 下载链接进行下载。
另外,LinkOut-more resources这里也可以链接到数据库,若数据库中的有全文链接,也可直接点击PDF进行下载。
05 临床研究文献检索
一般,Pubmed检索出的整体结果是未经分类,研究者需自行阅读分类或使用filter(滤器)自行筛选。因而,若想查看具有针对性的临床研究文章,也需花费大量的时间和精力。但是Pubmed主页里Pubmed Tools中的Clinical Queries可让研究者简便快捷的找到相关文献。
点击后,可进入以下界面,其中包括了三大板块:Clinical Study Categories(可选择病因、诊断、治疗、预后和临床预测指南等)、Systematic Reviews和Medical Genetics(临床遗传学)。
选择右下的see all,回到PubMed主页。输入你的二级关键词:TNF,点击搜索文章即可。
06 追踪最新文献
首先sign in to NCBI,即登陆“My NCBI”,没有的小伙伴可以注册一下。其次在搜索框中输入breast cancer,点击Search按钮后在新界面中点击Create alert。
在新的界面中,根据自己的研究热点来设置推送的文章内容,设置完成后点击save即可。
点击相应的位置,还可修改、删除原有设置。
07 英文期刊查询
当已知某篇英文文章时,以《Surgical treatment of pulmonary tuberculosis:the phoenix of thoracic surgery》为例,可在Pubmed中检索出该文章后,点击杂志名称J Thorac Dis,此时会跳出自动选择框,点击选择“Search in NLM Catalog”,即可进入杂志信息页面。
二、下载
01 输入关键词
在PubMed主页输入关键词,下图:
02 精确检索
输入关键词查到相关文献列表,可在左侧工具栏中勾选选项,进行更深度的检索(工具栏中有目录筛选、年份划分、文本可用类型、文章属性等),下图:
03 打开链接
检索到自己需要的文献点击篇名打开文献,会看到该文献的DOI和文献全文来源链接,点击文献来源链接,例如下面这篇文献:
04 下载
转下页找到全文,点击PDF下载键。下图:
05 保存
最后点保存标识,下图:
(图片来源于网络)